Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms