Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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