Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod4Q9JLH8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms