Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr5Q9JLF7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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