Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms