Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms