Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms