Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms