Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Aff4Q9ESC8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms