Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc97Q9DBT3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc97Q9DBT3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc97Q9DBT3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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