Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms