Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms