Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms