Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifi35Q9D8C4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms