Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms