Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms