Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms