Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prelid3bQ9CYY7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prelid3bQ9CYY7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prelid3bQ9CYY7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms