Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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