Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tmed5Q9CXE7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tmed5Q9CXE7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tmed5Q9CXE7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms