Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd4Q9CWX4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms