Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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