Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms