Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms