Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ergic3Q9CQE7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ergic3Q9CQE7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ergic3Q9CQE7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms