Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms