Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc5Q9CQA1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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