Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Chmp3Q9CQ10 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Chmp3Q9CQ10 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms