Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms