Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT4

Mydgf, Myeloid-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MydgfQ9CPT4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MydgfQ9CPT4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MydgfQ9CPT4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms