Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms