Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms