Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms