Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms