Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf19Q99KP6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms