Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx11Q91WL6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms