Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tdrd3Q91W18 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tdrd3Q91W18 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tdrd3Q91W18 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd3Q91W18 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.8 ms