Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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