Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms