Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms