Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms