Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms