Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frat2Q8K025 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms