Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms