Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms