Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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