Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrif1Q8CDD9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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