Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ufl1Q8CCJ3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ufl1Q8CCJ3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms