Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms