Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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